保障教育選擇權聯盟總召集人陳怡光指出，教育部日前提出的「擴大高中職及五專免試入學實施方案」，並沒有把全國自學家庭家長在公聽會的訴求納入，而只是採計學生在校成績和在校排名，做為免試高中入學的方法，甚至也有地方政府修法明定不得採計在家自學學生的成績，使得在家自學的孩子將沒有機會透過國中薦送或學生申請等模式參加免試入學。

教育部中教司科長徐振邦則回應表示，採計學生在校的學習表現，只是方案的配套措施，並不是必然要採行的方式，像是如果有些地區採行學區入學，就不會採計，同時，要是採行申請入學模式時，則依照高中職或五專的特色，規定0到3項的採計指標，也可以讓學生選擇完全不採計，只要登記就能入學，另外，對於在家自學學生的免試入學方式，會在方案研議訂定時，考量在家自學學生的權益予以保障。